塩基配列をどう読むか

l 塩基配列及びそこから翻訳されるアミノ酸配列の相同性を検索する.（　FASTA　/　BLAST　）

l ゲノムDNAから特徴的な配列を探す。

l ゲノムDNAからスプライス部位を推定する。 (Genescan)

l ゲノム情報から染色体上の位置やその他のゲノム情報を探す。（病態との関連）

l cDNAからオープンリーディングフレームを探す.

l タンパク質の相同性部位・構造モチーフを探す.（FASTA/BLAST/SMART）

l タンパク質を同定する。（生化学実験が必要・データベースとしてEntrezなど）

l 既に立体構造の解っている相同タンパク質がある場合、立体構造を予測することも可能。（SWISS-MODEL）