定時総会は毎年6月、全国から多数の会員の出席を得て実施しています。
総会では、前年度の会務、事業、収支等の報告を行うと共に、新年度の事業方針、収支予算案及び規則の改正案等を審議し、また明薬会功労者の表彰も行っています。当日は和やかな懇親会も開催されています。