タグ : QSAR
Tox24 Challengeの結果
2024年9月21日 研究ブログ
昨日、日本時間の9月20日深夜、オンライン上でTox24 Challengeの結果が発表されました。 前回Tox24 Challengeの記事に書いたように、このChallengeの最終結果はブラインドテストセットに対す …
Tox24 Challenge
2024年7月29日 研究ブログ
Tox24 ChallengeというQSARのコンペティションが進行中です(1, 2)。 Tox24チャレンジは、化合物のin vitro活性を予測するための計算手法の進歩を評価するために設計されています。 参加者に制限 …
化学構造による変異原性予測１９：カバー率100%における最良の予測モデルの詳細
2024年2月2日 研究ブログ
化学構造による変異原性予測１９：カバー率100%における最良の予測モデルの詳細 我々の構築したMMI-STK1モデルに関する詳細を、第二回Ames/QSAR国際チャレンジの開催中に当時博士課程の大学院生だった黒崎宏太博士 …
化学構造による変異原性予測１８：論文の概要
2024年1月23日 研究ブログ
本日、Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトの再解析論文がInternational Journal of Molecular Sciences誌（IF:5.6）に掲載されました。 Uesawa, Y. Progr …
化学構造による変異原性予測１7：論文がアクセプトされました！
2024年1月21日 研究ブログ
「化学構造による変異原性予測」のタイトルで記載してきた解析内容を盛り込んだ原著論文が、International Journal of Molecular Sciences誌にアクセプト（受理）されました！ …
化学構造による変異原性予測１６：in silico変異原性予測の到達点
2024年1月20日 研究ブログ
第１回＆第２回Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトに提出された109種類の予測結果を集計し、化合物のカバー率が100%だったときの予測性能を推定した結果、私たち明治薬科大学のグループが提出したMMI-STK1が最 …
化学構造による変異原性予測１５：上位の予測モデルの概要
2024年1月16日 研究ブログ
第1回および第2回Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトに提出された全109モデルを精査した結果、全テスト化合物を予測した（カバー率100%）と仮定したときの最良の予測モデルは、明治薬科大学のMMI-STK1である …
化学構造による変異原性予測１4：カバー率100％における「真の予測性能」
2024年1月14日 研究ブログ
Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトで提出された予測モデルの傾向として、回答のために選択された化合物の種類が少ないほど性能が高い傾向にあることが分かりました。 テストセット化合物に対するカバー率の少ないモデルほど …
化学構造による変異原性予測１３：予測性能に与えるカバー率の影響
2024年1月13日 研究ブログ
Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトは、各回各フェーズで１６００～４０００種類程度の化合物に関するAmes試験の実測結果に対する予測精度を競う、というコンペでした。 しかし、提示されたブラインドテストセット化合物 …
化学構造による変異原性予測１２：統合的評価指標
2024年1月12日 研究ブログ
Ames/QSAR国際チャレンジプロジェクトで使用されている評価指標の中で、インバランスなデータであるAmes試験結果の予測値の評価に適切なのはバランス精度、MCC、F1スコアの3種類であることを以前の記事で解説しました …
